Switch 2版《塞尔达传说：时之笛》在日本的分级为CERO B，适合12岁以上玩家。任天堂商店页面还为这款定于2026年11月5日发售的游戏列出“性”“暴力”“恐怖”“犯罪”四项内容标识。
相比之下，此前在Wii、Wii U上提供的原版，以及3DS版《塞尔达传说：时之笛3D》，日本分级均为CERO A。
作者推测，新版本的呈现方式可能让原有的恐怖或暴力元素更加显眼。目前分级机构尚未正式解释评级变化的原因，游戏内容是否因此有所改动也未获证实。